Le Capitaine Barbossa attaque Port-Royal et enlève Elizabeth Swann. Will Turner décide de la secourir et va s'associer avec un pirate très particulier : Jack Sparrow. Ensemble, ils écument les océans et vont devoir affronter la malédiction du Black Pearl, un navire composé d'un équipage de morts-vivants.
13 ans après que Jack Sparrow ait passé un accord avec Davy Jones afin d’être le capitaine du Black Pearl, il doit payer sa dette : devenir membre de l'équipage sur le Hollandais Volant ou se faire pourchasser par le kraken. Sa seule échappatoire est de trouver un coffre contenant le coeur de Davy Jones.
Lord Beckett a pour objectif d'en finir avec la piraterie. Davy Jones est contraints d'être sous ses ordres. La confrérie des pirates doit se réunir pour trouver un plan d'attaque. Will Turner et Elizabeth Swann s'associent avec Barbossa pour aller chercher Jack Sparrow dans un monde reculé.
Jack Sparrow est à la recherche de la fameuse fontaine de jouvence. Sur sa route, il croise une ancienne amie : Angelica Teach, au passé bien étrange. De plus, Jack va devoir affronter Barbossa qui est devenu un corsaire à la solde du roi d'Angleterre mais aussi la légende vivante des océans : Barbe Noire.